BK 306 sizin durumunuzu net olarak düzenliyor diye düşünüyorum:

Alıntı: b. Ayıbın giderilmesini isteme ve fesih MADDE 306. Kiracı, kiraya verenden kiralanandaki ayıbın uygun bir sürede giderilmesini isteyebilir; bu sürede ayıp giderilmezse kiracı, ayıbı kiraya veren hesabına gidertebilir ve bundan doğan alacağını kira bedelinden indirebilir veya kiralananın ayıpsız bir benzeri ile değiştirilmesini isteyebilir. Ayıbın, kiralananın öngörülen kullanıma elverişliliğini ortadan kaldırması ya da önemli ölçüde engellemesi ve verilen sürede giderilmemesi hâlinde kiracı, sözleşmeyi feshedebilir.

Dükkanın su almasının giderilmesi konusunda ihtarla süre vererek sözleşmeyi fesh edebileceğinizi düşünüyorum. Eğer süre vermeden fesih düşünüyorsanız, fesh etmeden önce delil tespiti yaptırmanız faydalı olabilir, zira sonrasında açılacak davada bunu ispat etmeniz zor olacaktır. Ayrıca bilirkişinin de "Ayıbın, kiralananın öngörülen kullanıma elverişliliğini ortadan kaldırması" noktasında yapacağı tespit de size derhal fesih için haklı bir gerekçe verebilir.