Suç nedeniyle açılan ceza soruşturması; idari yaptırım uygulamaya engel değildir. Suç nedeniyle bir yaptırım uygulanmışsa, o zaman idari para cezası verilemeyecektir. Zaten buna ne bis in idem ilkesi denmektedir. Bu ilke 42. madde de şu şekilde yer almıştır:
Yukarıdaki fıkralar uyarınca tahsil olunan idari para cezaları, aynı fiil nedeniyle 26/9/2004 tarihli ve 5237 sayılı Türk Ceza Kanununun 184 üncü maddesine göre mahkûm olanlara faizsiz olarak iade edilir.

İkinci olarak suç nedeniyle ceza verilmezse, kabahat nedeniyle idari para cezası verilir, cümlesine ilişkin olarak da;eğer aleyhine bu suçtan dolayı dava
açılan bireyler suç teşkil eden eylemin gerçekleşmediği veya sanığın bu suçu işlememesi nedeniyle beraat ederse, bu durum uygulanan idari para cezası aleyhine açılacak iptal davaları açısından da etkili olacaktır. (Melikşah YASİN- İmar Kanunun 42. maddesi Anayasa Mahkemesinin İptal Kararı ve Yeni Düzenleme Hakkında Bir Değerlendirme