Fatura üzerine kaşe basılması sadece ticari bir gelenektir ve her hangi bir şekilde ödemenin ispat aracı olarak kullanılamaz. Ödeme yaptıysanız ve elinizde yaptığınız ödemeye ilişkin bir belge var ise bu belgeleri ispat aracı olarak kullanabilirsiniz. Belgeyi imzalayan kişinin o şirkette sigortalı olarak çalışan ve konuyla ilgili kişi olması işlemin gerçekliği için yeterlidir ancak bunu ispat etmeniz biraz zor olabilir. Ayrıca size malı satan kişiye verdiğiniz çek nama mı yazılı yoksa hamiline mi? Nama yazılı ise ilgili bankadan ödenmiş olan çekin fotokopisini yada çekin kime ödendiğine ilişkin bir yazıyı delil olarak kullanabilirsiniz. Ancak hamiline yazılı bir çek verdiyseniz ödemenizi ispat edemezsiniz. Ayrıca şuna da dikkat etmelisiniz fatura karşı tarafın ticari defterlerine işlenmiş kayıtlarına geçirilmiştir. Yani faturayı kesen kişinin kimliği belirlenebilir, şirkette o iş ile alakadar kişi ise faturadan mesul olursunuz ancak yetkisi olmayan bir kişi (fatura iş sahibinin rızası dışında kesilmiş ise) ise faturanın geçerliliği yoktur.
http://www.alomaliye.com/talha_apak_..._irsfatura.htm

detaylı bilgiyi buradan bulabilirsiniz sanırım. Verdiğim bilgiler umarım işinize yarar.