Sözleşmenin tarafları ve mecur aynı ise (ki mesajınızdan öyle anlaşılıyor), 01.01.2009 tarihli kira sözleşmesi, diğer tarihli kira sözleşmesini fesih anlamı da taşımaktadır ve bu durumda geçerli tek sözleşme artık 01.01.2009 tarihli sözleşmedir. 01.01.2009 tarihinden sonraki bir hukuki ihtilaf için artık 2005 tarihli sözleşmenin dayanak yapılması söz konusu olamaz, dayanağınız 01.01.2009 sözleşme olmalıdır. Bu hukuki ilişkide 01.01.2005 tarihli sözleşmeyi ancak 01.01.2005-01.01.2009 arası bir ihtilaf için (örneğin bu dönemler arası ödenmeyen bir kira borcu) kullanabilirsiniz.

Mesajınızda ihtilafın hangi dönemlere ait olduğu ve neden iki sözleşmenin de hukuki dayanak yapılarak iki ayrı takip yapıldığı açık değil ancak belirttiğim kriteri kullanarak sorunuza yanıt bulabileceğinizi sanıyorum.